La Cofradía llegó a tener una filial en Gernika. Algunos alumnos y exalumnos eran naturales de este pueblo y así en 1947 por iniciativa de Daniel Olaortua Fano se fundaría esta filial.
 

Esta Cofradía salía en las procesiones de Gernika llevando una talla de Cristo atado a la Columna obra de Mateo Iñurria, maestro Cordobés. Por este motivo, la filial tomo el nombre de Cofradía de Cristo atado a la Columna.

​

Su primer Abad sería Miguel Ángel Olaortua Fano, por ser el hermano mayor de la saga de los Olaortua, y lo sería hasta 1961. La Cofradía procesiona hasta 1970, año en que se suprimen las procesiones de Gernika.